Münster- ve Walpodenstraße caddeleri arasında biraz gizlenmiş bir konumda, Protestan Altmünster Kilisesi yer almaktadır. İki beyaz kulesi ile modern ve sade bir tasarıma sahip olan bu bina, uzun ve hareketli tarihine dair pek bir ipucu vermemektedir. Efsaneye göre, erken Orta Çağ'dan itibaren "Altmünster" olarak anılan manastır, 700 yılında dönemin piskoposu Rigibert'in yeğeni "Bilehilt" (Azize Bilhildis) tarafından kadınlar için küçük bir manastır olarak kurulmuştur.

Manastır başlangıçta Benediktin kurallarına uyuyordu, ancak 13. yüzyıldaki Kilise reformu kapsamında Cistercian tarikatına bağlandı. Manastır, 17. yüzyılda Binger- ve Bahnhofstraße caddeleri arasındaki eski konumundan ayrılmak zorunda kaldı ve 100 metre daha güneyde erken Barok tarzında yeniden inşa edildi. Altmünster, başlangıçta zengin bir donanıma sahipti. En önemli kutsal emanet, her Paskalya Pazartesi günü sergilenen ve bugün katedralde bulunan İsa'nın ter bezi idi.

1802 yılında Altmünster Kilisesi, Mainz’da yeni kurulan Birleşik Evanjelik Cemaati’ne Fransız vali tarafından devredildi. Bu arada Altmünster’e yerleşmiş olan Jakobsberg Benediktinleri, kiliseyi ve manastırı boşaltmak zorunda kaldı. 30 Yıl Savaşları’ndan bu yana ilk kez Altmünster’de Mainz’a ait bir Evanjelik ayini kutlandı. Sadece birkaç yıl sonra Protestanlar, Napolyon'un emriyle küçük Welschnonnen Kilisesi'ne taşınmak zorunda kaldı. Fransız askeri idaresine bağlı Altmünster Manastırı, önce doğumevi, 1808'den itibaren ise askeri revir olarak kullanıldı. Sonraki yıllarda da Altmünster askeri amaçlarla kullanıldı: 1895'ten itibaren Protestan garnizon ibadet yeri ve son olarak Fransız-Katolik garnizon kilisesi olarak.

1929 yılında Mainz Protestan Cemaati, kiliseyi Reich Maliye Bakanlığı'ndan 88.000 Reichsmark karşılığında geri satın aldı. Altmünster Kilisesi, St. Johannis ve Christuskirche'den sonra şehrin üçüncü Protestan kilisesi olarak belirlendi.

Nazi döneminde kilise, komşu Wartburgheim ile birlikte "Alman Hıristiyanlar İnanç Hareketi"nin merkezi haline geldi ve 1936'dan itibaren yeniden garnizon kilisesi oldu. İkinci Dünya Savaşı'nda Altmünster'in yıkılmasının ardından cemaat hayatı tamamen durma noktasına geldi.

Kilise, ancak 1950'lerin sonunda mimar Otto Vogel tarafından dönemin tarzına uygun olarak yeniden tasarlanıp inşa edildi. Doğu cephesindeki süslemeler kaldırıldı, Geç Rönesans döneminden kalma giriş kapısı yıkıldı, kuleler yeniden düzenlendi ve pencereler küçültüldü. Ana giriş, batıya, Walpodenstraße'ye doğru taşındı.

Kilise 1960 yılında yeniden kutsanmış ve o günden beri Altmünster cemaatinin ibadet yeri olarak hizmet vermektedir. Müzik Yüksekokulu ile yapılan yakın işbirliği sayesinde Altmünster Kilisesi'nde iki org bulunmaktadır: Hafta içi öğrenciler burada prova yaparken, hafta sonları ve bayramlarda orglar ayinlerde çalınmaktadır.