Колекція налічує близько 3300 ранніх друкованих видань (від лат. «incunabula» = пелюшка, колиска). Окрім двох Біблій Гутенберга, до колекції також входять, серед іншого, примірники знаменитої «Всесвітньої хроніки» Гартмана Шеделя (1493) та «Космографії» (1482), друкованого атласу за Птолемеєм, який вважається віхою в історії друку карт. У колекції також представлено одне з найкрасивіших творів XV століття. «Hypnerotomachia Poliphili» (Сон Поліфіла) Франческо Колонни 1492 року з гравюрами на дереві в стилі італійського ренесансу вважається шедевром раннього книгодрукарства.

Колекції XVI–XVIII століть відображають тематичну та медійну різноманітність і розвиток книги. Серед найцікавіших експонатів колекції – «Корабель дурнів» Себастьяна Брандта (1506) з гравюрами на дереві, які, ймовірно, частково були створені молодим Альбрехтом Дюрером, та романтичний лицарський роман «Теуерданк» (1517), яким молодий імператор Максиміліан I створив собі пам'ятник. До колекції також входять важливі наукові праці, такі як «Astronomicum Caesareum», астрономічна книга для імператора Карла V, надрукована Петром Апіаном в 1540 році в Інгольштадті.

Колекція, присвячена історії книги з 19 по 21 століття, знаходиться в полі напруги між промисловим масовим виробництвом і художньо вишуканими виданнями книг, які часто виходили невеликими тиражами в невеликих видавництвах. Важливі експонати походять, зокрема, від видатних майстрів шрифту в стилі модерн, таких як Отто Екманн і Рудольф Кох, а також від ілюстраторів, серед яких Маркус Бехмер і Томас Теодор Хайн. Зразки шрифтів і книги зразків шрифтів від найважливіших шрифтових ливарних заводів і найвидатніших майстрів шрифту наочно ілюструють розвиток типографіки.

Колекція музею Гутенберга налічує близько 2500 друкованих видань кінця 19 – 21 століття. Книги, виготовлені за допомогою складних художньо-ремісничих технік, свідомо відрізняються від масової продукції «книги», яка з'явилася на початку 20 століття завдяки розвитку друкарських технологій. Друковані видання часто вирізняються вишуканим оформленням. Кожному етапу виготовлення книги — від вибору шрифту, верстки, друку та ілюстрації — приділяється особлива увага, завдяки чому книга стає «мистецьким твором».

До колекції також входять дитячі книги XVIII–XX століть. Серед найважливіших творів — «Ілюстрована книга для дітей» Фрідріха Юстіна Бертуха, видана в 1790 році, та «Струвельпетер» Генріха Гофмана (1844). До колекції також входять ілюстровані книги відомих ілюстраторів 19-го і 20-го століть, таких як Кейт Грінавей, Артур Ракхем, Ернст Крейдольф, Лізелотте Шварц і Моріс Сендак.

Мініатюрними книгами називають книги, розмір яких не перевищує 10x10 см. Завдяки колекції Гайнца Мюллера, яку вдалося придбати в 2012 році, Музей Гутенберга володіє найбільшим в Європі фондом мініатюрних книг, що налічує близько 6900 примірників. Колекція включає в себе художню літературу, словники, кулінарні книги та календарі і пропонує унікальний погляд на світ найменших книг.

Роздуми про роль книги в сучасності спонукають багатьох митців створювати книги як об'єкти, які часто відчужують або заперечують читання. У колекції книг митців Музею Гутенберга представлені, зокрема, твори Карлгайнца Цвіка, Юлії Фаррер, Антона Вюрта та Барбари Байзінггоф.

Колекція літератури з листування налічує понад 450 видань, тобто посібників з написання листів, серед яких є цінні інкунабули, датовані до 1500 року. Ця високоякісна колекція дає ґрунтовне уявлення про історію та розвиток листування протягом останніх шести століть аж до сьогодення.

Надзвичайно обширна колекція книг, яка містить майже всі збережені видання цього жанру з німецькомовних країн, була зібрана доктором Ервіном Креймом (Майнц) і передана в 2011 році в дар Музею Гутенберга. У своїй комплексності вона відкриває огляд публічної та приватної комунікації, що стало можливим не в останню чергу завдяки винаходу Йоганна Гутенберга.

Сьогодні поняття «листопис» є практично невідомим, хоча друковані інструкції з написання листів колись були дуже популярними. Так, Анатоль Пол Бройард (1920-1990), видавець New York Times, коментував: «У наш час, коли ми не схильні писати листи, ми легко забуваємо, яку роль вони колись відігравали в житті людей».