El trabajo científico se centra en la investigación basada en las colecciones. Junto con la Colección Regional de Historia Natural de Renania-Palatinado, el Museo de Historia Natural cuenta con una colección de investigación de unos 2 millones de objetos, en su mayoría de origen regional, que, como infraestructura de investigación para la ciencia, desempeñan un papel importante en la investigación sobre el clima y la biodiversidad.