بالإضافة إلى مراعاة شؤون حماية الأنواع في التخطيط المكاني، يتعامل قسم حماية الأنواع أيضًا مع مراقبة تجارة الأنواع المحمية وحيازتها ونقلها. فالتجارة غير المشروعة بالأنواع الحيوانية والنباتية الغريبة لا تزال تمثل تجارة تقدر بملايين الدولارات. العديد من الأنواع مهددة بالانقراض وتخضع لحظر تجاري صارم. ومع ذلك، ازدادت التجارة غير المشروعة وأدت إلى انخفاض أعداد العديد من الحيوانات والنباتات.

ولكن الأنواع الحيوانية والنباتية المهددة بالانقراض محمية أيضًا داخل ألمانيا وأوروبا. على سبيل المثال، لا يجوز قتل هذه الأنواع أو إخراجها من الطبيعة. إلى جانب اتفاقية واشنطن لحماية الأنواع واللائحة التنفيذية للاتحاد الأوروبي لحماية الأنواع، تعتبر اللائحة الأوروبية لحماية النباتات والحيوانات والبيئة الطبيعية واللائحة الأوروبية لحماية الطيور، وكذلك القانون الاتحادي لحماية الطبيعة واللائحة الاتحادية لحماية الأنواع، ذات أهمية كبيرة.

تتولى إدارة البيئة والمساحات الخضراء المسؤولية عن المهام التالية في مجال حماية الأنواع:

• حفظ البيانات المتعلقة بجميع الأفراد من الأنواع المحمية الخاضعة للإبلاغ والموجودة في منطقة المدينة
• إصدار شهادات للتسويق والنقل (داخل الاتحاد الأوروبي)
• مراقبة سجلات التربية
• مراقبة التجارة
• تحديد المخالفات ومعاقبة مرتكبيها، ومصادرة العينات