Le service d'audit est une entité autonome qui contrôle, en toute indépendance et sans recevoir d'instructions, la gestion budgétaire et financière de la ville de Mayence et rend compte directement de ses conclusions au maire. Le service d'audit examine les comptes annuels et les comptes consolidés, ainsi que la régularité, la pertinence et la rentabilité de la gestion administrative.

Parmi ses autres missions figurent le service de lutte contre la corruption et le bureau de signalement prévu par la loi sur la protection des lanceurs d'alerte, ainsi que le contrôle de la sécurité de l'information.