La direzione dei Vigili del Fuoco di Magonza è affidata al capo del corpo, che ricopre anche la carica di massimo responsabile operativo del corpo.
In caso di gravi calamità o interventi particolari, egli assume la direzione delle operazioni o costituisce uno stato maggiore sotto forma di direzione tecnica delle operazioni. La direzione politica spetta al sindaco.
Poiché il capo del corpo dirige anche i Vigili del Fuoco volontari, ricopre anche la funzione di ispettore dei Vigili del Fuoco cittadini.